El Teniente Reed y el alférez Mayweather + ) juegan al ajedrez mientras sirven como anfitriones a extraterrestres no corpóreos conocidos como organianos . Al regresar de una misión en el planeta de abajo, el Comandante Tucker y la Alférez pronto presentan síntomas de una extraña enfermedad. Tras el examen por el Doctor Phlox, se encuentra que es un virus altamente contagioso con base de silicio.virus, que la fisiología basada en el carbono no puede contrarrestar. Para pasar el tiempo, mientras están aislados en Descontaminación, Tucker y Sato intentan aprender más el uno del otro.
Los organianos están muy interesados en examinar la respuesta humana a esta crisis y comparan notas con reacciones anteriores de klingons y cardassianos . Son miembros de una especie avanzada que busca hacer un " primer contacto ". Durante 800 años, la pareja ha estado observando pasivamente varias especies que viajan por el espacio mientras reaccionan al patógeno, pero aún no se ha considerado que ninguna especie esté lista. Buscando una visión diferente de la tripulación, cambian de forma variable a los cuerpos del Capitán Archer el Comandante T’Pol y Phlox. Los dos organianos comienzan a estar en desacuerdo: uno parece decidido a mantener su protocolo de no interferencia, mientras que el otro siente que el protocolo está desactualizado e innecesario.
Con el tiempo agotándose, Phlox y T’Pol encuentran una manera de interrumpir el virus utilizando niveles letales de radiación. Archer y Phlox, mientras usan trajes ambientales , acompañan a Tucker y Sato a Sickbay para recibir tratamiento. Sato pronto sufre un paro cardíaco y Archer se quita los guantes y el casco para ayudarla, pero no puede ser resucitada. Luego administran una dosis de radiación a Tucker, pero él también muere.
De repente, los organianos poseen a Tucker y Sato, y le explican la situación a un sorprendido Archer, incluida la imparable propagación de la infección. Archer suplica en nombre de su tripulación, señalando que los organianos han perdido la empatía, confundiendo la no intervención después del hecho con la opción dañina de no publicar advertencias sobre el virus. Deciden modificar su protocolo, eligiendo resucitar y curar a los miembros de la tripulación infectados, cuando anteriormente habrían dejado morir a toda la tripulación. Borran el encuentro de la memoria de la tripulación. Archer ordena que se coloque una baliza de advertencia sobre el planeta, y los organianos se van para comenzar a planificar el primer contacto con los humanos dentro de 100 años .