Aparentemente, McCoy tiene una relación conflictiva con el primer oficial vulcano de la nave, Spock. La pareja discute constantemente debido a la personalidad más emocional de McCoy frente al comportamiento lógico de Spock. A menudo se puede escuchar al médico desafiando audazmente la naturaleza fría y distante de Vulcan, mientras que el comentario de Spock tiende a ser más sutil pero igualmente mordaz. En verdad, McCoy es tan cercano a Spock como lo es a Kirk, e incluso pasaron juntos un permiso en tierra en un viaje de campamento en 2287.
Durante casi 30 años, el Dr. Leonard McCoy sirvió como Oficial Médico en naves que llevaban el nombre de Enterprise. Su servicio en el primer U.S.S. Enterprise NCC-1701 comenzó en 2266 bajo el mando del Capitán James Kirk, un oficial que se convertiría en uno de sus más cercanos.
La relación de McCoy con la tecnología es igualmente conflictiva. Celebra los beneficios de los avances médicos de su tiempo, particularmente en comparación con los métodos practicados en la Tierra cuando viajó 300 años atrás en el tiempo. Sin embargo, desconfía de otras tecnologías innovadoras como los transportadores y los androides. Aún así, ha considerado a la Enterprise tecnológicamente avanzada como su hogar durante mucho tiempo.
El verdadero McCoy
McCoy, graduado de la Universidad de Mississippi, se enfrentó a una de sus decisiones más difíciles al principio de su carrera médica cuando su padre padecía una enfermedad terminal. En lugar de permitir que su padre sufriera, McCoy le quitó el soporte vital para que pudiera morir en paz. Trágicamente, poco después se encontró una cura para la enfermedad y esa fatídica decisión persiguió a McCoy en los años venideros.
McCoy estuvo casado por un tiempo, aunque su matrimonio terminó antes de su destino en el Enterprise. Otras relaciones románticas incluyeron una cita con Emony Dax, un simbionte Trill, y una relación con la futura Sra. Nancy Crater. En una misión, McCoy se recontró con la mujer que creía que era Nancy, pero en realidad era el único miembro superviviente de una especie que se hacía pasar por su antiguo amor, ahora fallecida. McCoy se enfrentó muchos desafíos médicos durante la primera misión histórica que sirvió en el Enterprise y fue responsable de salvar a sus compañeros de tripulación en varias ocasiones.
Uno de sus problemas de salud personal más notables ocurrió cuando se inyecto accidentalmente una gran dosis del estimulante químico cordrazina. Como resultado, sufrió graves delirios paranoicos que lo llevaron a saltar a un portal del tiempo y desencadenar un desastre temporal. Afortunadamente, Kirk y Spock pudieron corregir el daño y rectificar el la línea del tiempo anterior.
Carrera posterior
McCoy se retiró de la Flota Estelar después de la misión inicial de cinco años de la nave, pero Kirk lo reclutó nuevamente cuando la Tierra se vio amenazada por V’Ger, una sonda
espacial que desarrolló una forma de sensibilidad artificial. Como miembro de la tripulación del Enterprise una vez más, McCoy participó en muchas más aventuras en el barco. Uno de los desafíos más emocionales ocurrió durante el segundo encuentro de la tripulación con el villano Khan Noonien Singh, que condujo a la muerte del amigo de McCoy y 
compañero de combate verbal, Spock. Antes de su muerte inminente, Spock transfirió en secreto su katra, o espíritu viviente, al Dr. McCoy.
Sin que McCoy lo supiera, Spock usó técnicas vulcanianas para dejar inconsciente al médico, transfiriendo su katra (espíritu vivo) a la mente de McCoy para que pudiera ser devuelto a Vulcan después de la muerte de Spock. Poco después de la transferencia, el comportamiento de McCoy se volvió errático gracias a la influencia de Spock. Después de su regreso a la Tierra, intentó alquilar una nave para llevarlo al planeta Génesis prohibido. En ese momento fue puesto bajo custodia de la Flota Estelar.
Una vez que Kirk se dio cuenta de lo que había ocurrido, él y su tripulación sacaron a McCoy del encierro y viajaron al planeta Génesis para recuperar su cuerpo sorprendentemente revivido de Spock y reunirlo con el alma de Spock.
Años más tarde, McCoy formó parte de la delegación elegida para escoltar a los dignatarios klingon a la conferencia de paz de Khitomer que eventualmente uniría a la Federación con el Imperio Klingon. Las fuerzas que conspiraron contra la unificación acusaron a la tripulación del Enterprise del asesinato del canciller klingon Gorkon. Cuando el médico no pudo salvar a los klingon, él y Kirk fueron arrestados por su participación, llevados a juicio y finalmente sentenciados a la colonia penal klingon en el planetoide Rura Penthe. La tripulación del Enterprise rescató a McCoy y Kirk de su prisión klingon y descubrió al verdadero culpable en una camarilla de oficiales descontentos, incluido el propio jefe de personal de Gorkon, el general Chang, absolviendo a los hombres de sus crímenes.
El Dr. McCoy finalmente dejó la Flota Estelar con el rango de almirante. Aunque ya no estaba en el servicio, el médico todavía actuaba como dignatario en funciones ceremoniales. En la fecha estelar 41153.7 a la edad de 137 años, el almirante McCoy realizó una inspección del U.S.S. EnterpriseNCC-1701-D durante su primera misión. Era la ultima nave en compartir el nombre que aquella en la
que había servido con tanto orgullo.
La incursión temporal
El divorcio de Leonard McCous estaba reciente en su mente cuando se alistó en al Flota Estelar años después de la incursión temporal de 2230. Estaba un poco molesto por la situación. Conoció a Jim Kirk en la lanzadera a la Academia de la Flota Estelar.
La amistad de McCoy con Kirk se fraguo durante su tiempo en la academia con el buen doctor cuestionando las decisiones impulsivas. Cuando Kirk estuvo amenazado con ser expulsado fue forzado al servicio inactivo, fue McCoy quien pensó rápidamente e hizo que el cadete subiera a bordo del Enterprise cuando la nave estaba a punto de responder a una llamada de socorro del planeta Vulcano. Durante el encuentro con la nave minera romulana, el Narada, el Oficial Medico Jefe del Enterprise Enterprise murió y el Dr. McCoy fue ascendido al puesto.
Aunque McCoy no estuvo de acuerdo con la decisión de Spock de abandonar a Kirk en un planeta después del incidente inicial con el Narada, no detuvo a su nuevo capitán Cuando Kirk regresó a la nave y recuperó el mando. McCoy se mostró igualmente combativo cuando las Órdenes de Kirk resultaron cuestionables, aunque asumió su papel según las instrucciones.
McCoy siguió sirviendo como Oficial Medico Jefe Arkin rescatando a una tribu en Nibiru en lo que finalmente se convirtió en una clara violación de la Primera Directiva. Durante una misión posterior, mientras examinaba lo que se pensaba que era un torpedo de fotones experimental, McCoy activó accidentalmente el dispositivo y descubrió que albergaba a una persona en estasis criogénica. El sorprendente descubrimiento ayudó a explicar las acciones del terrorista John Harrison, quien resultó ser Khan Noonien Singh. El estudio de McCoy de la composición genética de Khan llevó al descubrimiento de que su sangre poseía propiedades curativas casi milagrosas. Cuando Kirk murió después de reparar el reactor de núcleo warp irradiado, McCoy le inyectó una dosis de la sangre de Khan. Esta acción totalmente poco ortodoxa salvó la vida de Kirk, lo que permitió que la pareja continuara juntos en futuras misiones.
Trio al mando
McCoy disfrutó burlándose de su capitán, ya que él y Kirk se hicieron buenos amigos durante su tiempo en la Academia y en el espacio. Brindó en privado por Kirk en su cumpleaños
durante el tercer año de su misión inicial, reconociendo las emociones encontradas que su capitán debe experimentar en una fecha compartida con la trágica pérdida de su padre.
La relación de McCoy con el primer oficial Spock también estuvo llena de bromas, aunque teñidas con un poco más de sarcasmo. Cuando el Enterprise se estrelló en el planeta Altamid, McCoy y Spock se separaron brevemente del resto de la tripulación. McCoy curó al Vulcano herido y se asoció con él para escapar de sus captores y reunirse con el Capitán Kirk.
Aunque el miedo del médico a los viajes espaciales está bien documentado, continuó trabajando con Spock al mando de una nave alienígena y ayudar a salvar la Base Estelar Yorktown. Sin embargo, esta nueva asociación no le impidió seguir bromeando alegremente a expensas del primer oficial.
CUADERNO DE BITACORA 