Las relaciones entre la Federación Unida de Planetas y el Imperio Klingon han alcanzado el punto álgido, y las negociaciones más recientes han fracasado. el USS Enterprise ha sido enviado a Organia, un planeta no alineado cerca de la frontera con los Klingons, con el propósito de protegerlo ya que se teme que los Klingons tratarán de anexionarlo al imperio Klingon.
Cuando el Enterprise se aproxima a Organia es atacado por una nave Klingon, que es destruida. Kirk alerta a los Organianos acerca de las intenciones de los Klingons, pero éstos están completamente desinteresados por la situación. Por el contrario, insisten en que el Enterprise y su tripulación están en peligro. De improviso una flota Klingon aparece, forzando al Enterprise a retirarse, dejando abandonados en la superficie del planeta a Kirk y a Spock.
Los Klingons toman el control del planeta sin ninguna resistencia por parte de sus habitantes y situan al oficial Klingon de mayor rango, Kor, como gobernador militar de Organia. Los Organianos encubren a Kirk y a Spock haciéndoles pasar por Organianos, pero rehúsan hacer algo más para resistir la ocupación. Kirk y Spock comienzan a realizar operaciones de guerrilla por iniciativa propia, a pesar de las objeciones de los Organianos.
Cuando los Klingons se presentan ante el consejo gobernante Organiano y amenazan con torturar a Kirk y a Spock como sospechosos de ser insurgentes, los Organianos revelan las verdaderas identidades de Kirk y Spock y permiten que sean arrestados. Después interrogatorio, Kirk y Spock son encarcelados. Poco después, los Organianos les liberan a los dos sin realizar ningún esfuerzo, y los esconden en la Sala del Consejo.
Mientras Kirk y Spock tratan de comprender las contradictorias acciones de los nativos, Kor ordena, como represalia por la huida, ejecuciones en masa. A pesar de esto, los Organianos continúan protegiendo a Kirk y a Spock, y permanecen impertérritos ante las acciones de los Klingon, dejando tanto a los oficiales de la Federación como a los Klingon desconcertados y frustrados.
A medida que las flotas de la Federación y de los Klingon convergen en el sistema, amenazando con un inminente comienzo de una guerra, Kirk y Spock llevan a cabo un temerario ataque sobre el cuartel general de los Klingon con la esperanza de que la población se subleve y organice la resistencia. Logran un sorprendente éxito, capturando a Kor y preparándose para hacer una escaramuza mientras las flotas están listas para enfrentarse.
En ese momento, los Organianos revelan su verdadera naturaleza. Incapacitan instantáneamente a ambos bandos, no sólo alrededor del planeta, sino en todas partes. No son primitivos humanoides, sino todo lo contrario, resultando seres de energía altamente avanzados y extremadamente poderosos, mucho más allá de las capacidades de los Klingons y de la Federación, de tal forma que nunca estuvieron amenazados por ninguno de los dos bandos. Los Organianos fuerzan a los humanos y a los Klingon a firmar una tregua, el Tratado de Paz Organiano. Ambos bandos protestan, pero los Organianos predicen que los dos rivales serán aliados en el futuro, más allá de lo que ellos son capaces de imaginar en la actualidad.
De regreso al Enterprise, Kirk admite su vergüenza en su decepción inicial con el fin forzado de la guerra y el tratado de paz impuesto.
Miguel SJ