El Enterprise llega a Omicron Ceti III, donde una colonia de la Federación se estableció hacía ya varios años. Sin embargo el planeta se encuentra sometido al bombardeo de rayos Berthold, una forma mortal de radiación que causa severos daños a los tejidos después de unas pocas semanas de exposición. Por si fuera poco, no han existido comunicaciones con la colonia desde hace un tiempo. La triste misión del Enterprise es recuperar los restos mortales de los colonos y su equipo.
El capitán Kirk, junto a Spock, McCoy, Sulu y otros tripulantes, se transportan a la superficie del planeta y hacen el sorprendente descubrimiento de que los colonos se encuentran vivos. La tripulación es recibida amablemente por Elias Sandoval, un granjero y líder de los colonos quien les asegura que no ha habido problemas aparte de que el sistema de comunicaciones ha fallado. También ellos conocen a otra colona, Leila Kalomi, quien tuvo una relación con el Sr. Spock seis años antes en la Tierra. Aun no teniendo ninguna idea de cómo ni por qué estas personas aún están con vida, el Dr. McCoy prepara una serie de exámenes médicos para los colonos mientras otros miembros de la tripulación exploran las cercanías buscando la respuesta a este fenómeno.
El misterio se profundiza cuando McCoy encuentra que los colonos gozan de plena salud. Al revisar los registros médicos de los colonos, descubre que, aunque el registro indicaba que a Sandoval le había sido extirpado el apéndice, su examen había mostrado que Sandoval tiene su apéndice intacto. Los otros miembros del equipo de salida descubren que no existe ninguna vida animal en el planeta — no hay ganado, ni pájaros ni tampoco insectos. Evadiendo las preguntas de Kirk acerca del destino de los animales domésticos que habían llevado con ellos y la ausencia general de vida animal en el planeta, Sandoval explica simplemente que son vegetarianos.
Cuando Spock se encuentra explorando los alrededores buscando claves para explicar la situación, Leila se encuentra con él y le dice que le mostrará cómo los colonos han logrado sobrevivir. Lo lleva a un lugar donde unas extrañas flores le disparan una ráfaga de esporas.
Siendo medio Vulcano, Spock normalmente no expresa sus emociones, pero momentos después de ser expuesto a las esporas, el anteriormente lógico Spock es capaz de decirle a Leila «Te amo». Ahora libre para encontrar la felicidad con Leila, Spock ríe y con su cabeza en el regazo de Leila, contempla idílicamente las nubes. Cuando Kirk intenta ponerse en contacto con él, no es Spock sino Leila quien activa el comunicador. No deseando por el momento parar de abrazar, acariciar y besar a Leila, Spock responde a las preguntas de Kirk con una divertida brusquedad y rehúsa obedecer órdenes.
Spock le muestra las extrañas flores a Kirk y a otros miembros de la tripulación, y reciben una ráfaga de las extrañas esporas, pero el capitán Kirk escapa de esto ya que se encuentra fuera del alcance de la planta. Cuando Kirk regresa a la nave, ésta se encuentra llena de flores y sus esporas. Toda la tripulación, en una abierta pero pacífica rebelión se amotina, y comienza a bajar a la superficie del planeta. Antes de bajar, la teniente Uhura sabotea el sistema de comunicaciones de la nave.
Pronto, Kirk es la única persona que permanece a bordo de la nave. Dado que ésta se encuentra llena de las plantas, esta vez Kirk sí que es alcanzado por ellas y poco después comienza a sentirse en paz y planea bajar a la superficie del planeta, pero cuando está a punto de dejar al Enterprise, siente remordimientos al reflexionar sobre su carrera, causándole una serie de violentas emociones, que abruman y destruyen las esporas dentro de su cuerpo.
Kirk se da cuenta ahora que las esporas no pueden sobrevivir en presencia de fuertes sentimientos. Entonces pide a Spock que suba a bordo para ayudarle con algunas cosas que no serán capaces de recuperar una vez que el último de los tripulantes abandone la nave. Lo que Kirk realmente quiere es que Spock se recupere. Kirk, registra en su cuaderno de bitácora que su plan es acabar con las esporas dentro de Spock haciéndolo enojare, lo cual es muy arriesgado ya que Spock es medio vulcano, un humanoide muchísimo más fuerte que un humano, cuya raza eran feroces guerreros antes de que su control de las emociones terminara las matanzas en su mundo.
No obstante, cuando Spock llega, Kirk lo insulta con insultos racistas tras un rato Spock se enfurece y pelea con Kirk pero afortunadamente su racionalidad regresa antes de que hiera seriamente al capitán. Crean un dispositivo para enviar una frecuencia subsónica a través de los comunicadores que irritará a toda la colonia. Poco después, las peleas comienzan a surgir por todo el lugar, lo que acaba rápidamente la influencia de las esporas.
Después de un rato y una vez que las cosas han vuelto a la normalidad, Spock le pide a Leila que suba a la nave. Ella sube a bordo para encontrarse con que Spock ya no está más «con nosotros», y le ruega desesperadamente que regrese con ella al planeta para que puedan estar juntos. Sentidamente, él le dice a ella que tiene responsabilidades en la nave y que no lo puede hacer. Leila comienza a llorar y le reitera su amor. Spock la abraza. Luego ella le pregunta si tiene otro nombre aparte de Spock. Él la coge en sus brazos y le seca gentilmente una lágrima de su mejilla. Él sonríe melancólicamente y sencillamente responde que no podría pronunciarlo
Finalmente el Enterprise abandona el sistema con los colonos a bordo.
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